不确定系統研究所成立于2005年12月, 彭錦教授任研究所所長。本所具有四個特色鮮明的研究方向, 即不确定理論與不确定規劃、系統控制與可靠性、智能計算及應用、空間信息處理與應用。每個研究方向均由具有碩士生導師資格的教授或博士作為學術帶頭人, 力量配備齊全, 梯隊層次合理。
研究所研究人員一直共同緻力于不确定性理論及其應用方面的有關研究工作, 密切追蹤國際、國内最新研究動态, 近五年來取得了一系列高水平的研究成果：在國際期刊、國内權威期刊、核心期刊、國際國内會議上等公開發表學術論文280餘篇, 其中SCI、EI、ISTP三大檢索論文共90餘篇，其中SCI檢索14篇，EI檢索43篇，ISTP檢索37篇；出版了學術著作10部,主編教材6部，主編會議論文集3部；獲“鐘家慶運籌學獎”1項、湖北省自然科學優秀學術論文獎2項、黃岡市自然科學優秀學術論文獎10項。
研究所共承擔了國家自然科學基金項目 、湖北省教育廳自然科學科研重點項目 、湖北省教育廳優秀中青年人才項目 、湖北省科技廳優秀中青年人才國際科技合作與交流項目 、湖北省教育廳科研重大項目 、湖北省高等學校優秀中青年科技創新團隊項目 、湖北省自然科學基金項目等20餘個項目的研究。
本所先後成功舉辦了兩次全國性學術會議，即“第九屆中國青年信息與管理學者大會暨第五屆中國不确定系統年會”和“第一屆中國智能計算大會”。